所有管路在天花板下面布設，并通過功能柱到中央臺，邊臺的氣體管路隱藏在實驗工作臺后面服務通道內。焊接聯接的強度和密封性，適用于各種管道，省工省料，但拆卸時必須切斷管子和管子聯接件。通過氣瓶和輸送管道將載氣輸送給儀器，在氣瓶出口裝有單向閥，可避免更換氣瓶時有空氣和水分混入，另外在一端安裝泄壓開關球閥，將多余的空氣和水分排放后再接入儀器管道，保證儀器用氣的純度。

實驗室的氣體供應不同于一般工廠的要求，首先表現在儀器設備對氣體的純度要求較高，一般工作氣體要求達到99.999%以上，其次氣體的供應必須連續，輸出壓力平穩，氣體的壓力波動可能導致儀器設備無法正常工作，氣體的不連續供應甚至可能導致儀器設備故障，因此實驗室氣體管路的設計必須非常嚴格。所有氣體管路都由高質量的、完全退火型、無縫連接的不銹鋼管SS-316L組成。銅管只使用在氣體管路的末端和氣體純度不是要求太嚴格的地方（比如通風柜）。氣體管道可能承受許多種外力的作用，包括本身的重量、氣體作用在管端的推力、風雪載荷、土壤壓力、熱脹冷縮引起的熱應力、振動載荷和災害等。

為了排除凝結水，蒸汽和其他含水的氣體管道應有一定的坡度，一般不小于千分之二。對于利用重力流動的地下排水管道，坡度不小于千分之五。氣相色譜工作臺上均勻的排放各種氣體的出口，管徑為3.18mm，在氦氣管路前面建議安裝氣體凈化裝置。聯接時，一般在承插口的槽內先填入麻絲、棉線或石棉繩，然后再用石棉水泥或鉛等材料填實，還可在承插口內填入橡膠密封環，使其具有較好的柔性，容許管子有少量的移動。

蒸汽或其他含水的氣體管道在點設置排水管或疏水閥，某些氣體管道還設有氣水分離器，以便及時排去水液，防止管內產生水擊和阻礙氣體流動。在1.6兆帕以上壓力時，一般在管子端面加墊片密封。這種聯接方法簡單，可以拆卸重裝，但須在管道的適當地方安裝活接頭，以便于拆裝。所有管路的連接為無縫焊接。連接到閥門或調節裝置時，才可以使用壓力配件。