深層發酵生產檸檬酸的主體設備是發酵罐。微生物在這個密閉容器內繁殖與發酵。現多采用通用發酵罐。它的主要部件包括罐體、攪拌器、冷卻裝置、空氣分布裝置、消泡器，軸封及其他附屬裝置。發酵罐徑高比例一般是1:2.5，應能承受一定的壓力，并有良好的密封性。除通用式發酵罐外，還可采用帶升式發酵罐、塔式發酵罐和噴射自吸式發酵罐等。他是通過在水果榨汁中加入石灰乳以形成檸檬酸鈣沉淀的方法制取檸檬酸的。

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為了得到產檸檬酸的優良，通常是從不同地區采集的土壤或從腐爛的水果中分離篩選，然后通過物理和化學方法進行選育。例如薯干粉深層發酵檸檬酸的就是通過檸檬酸不斷變異和選育得到的。適合在高濃度下發酵，產酸水平較高。

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檸檬酸又名枸櫞酸，天然的檸檬酸存在于水果中，如檸檬、柑橘等。人工合成的檸檬酸是用砂糖、糖蜜、淀粉、葡萄等含糖物質發酵而制得的，可分為無水和水合物兩種。純品檸檬酸為無色透明結晶或白色粉末，無臭，有一種誘人的酸味。

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