LncRNA芯片

Long non-coding RNAs（lncRNAs）是一類轉(zhuǎn)錄本長(zhǎng)度超過200 nt的功能性非編碼RNA分子。分子實(shí)驗(yàn)介紹——印跡（Westernblot）檢測(cè)通過SDS-PAGE凝膠將細(xì)胞或生物樣品內(nèi)的蛋白按照蛋白分子量從大到小規(guī)律分離開。目前的研究已證實(shí)，lncRNA參與X染色體沉默，基因組印記以及染色質(zhì)修飾，轉(zhuǎn)錄ji活，轉(zhuǎn)錄干擾，核內(nèi)運(yùn)輸?shù)榷喾N重要調(diào)控過程。隨著對(duì)lncRNA在哺乳動(dòng)物進(jìn)化及人類疾病發(fā)生和發(fā)展中作用的日益關(guān)注，lncRNA調(diào)控機(jī)制已成為當(dāng)前遺傳學(xué)研究的熱點(diǎn)問題。

篩選出差異表達(dá)的lncRNA是研究其在人類疾病發(fā)生中所扮演角色的基礎(chǔ)。富衡生物為用戶提供高通量的lncRNA芯片進(jìn)行l(wèi)ncRNA表達(dá)譜分析，該芯片基于Agilent的SurePrint技術(shù)生產(chǎn)，實(shí)驗(yàn)。

技術(shù)優(yōu)勢(shì)

信息覆蓋廣泛：覆蓋了多個(gè)quan威lncRNA數(shù)據(jù)庫(kù)發(fā)布的數(shù)據(jù)；提供人，小鼠，大鼠的lncRNA檢測(cè)。

lncRNA和mRNA同時(shí)檢測(cè)：芯片上包含有的lncRNA和新的mRNA序列檢測(cè)探針。一次芯片實(shí)驗(yàn)可同時(shí)對(duì)lncRNA和mRNA進(jìn)行分析。

平臺(tái)成熟可靠：采用Agilent原位噴墨合成技術(shù)，了高檢測(cè)靈敏度和特異性。

數(shù)據(jù)分析：提供lncRNA和mRNA表達(dá)譜差異分析和功能分析，以及二者的關(guān)聯(lián)分析。

lncRNA測(cè)序

長(zhǎng)鏈非編碼RNAs（long non-coding RNAs，lncRNAs）一般是指長(zhǎng)度大于200 nt的RNA，位于細(xì)胞核內(nèi)或胞漿中，不參與蛋白質(zhì)編碼功能，以RNA形式在多種層面上（表觀遺傳調(diào)控、轉(zhuǎn)錄調(diào)控以及轉(zhuǎn)錄后調(diào)控等）調(diào)控基因的表達(dá)水平，在生命活動(dòng)中具有重要作用。他們的結(jié)果表明，NimbleGen平臺(tái)作為一個(gè)使用高密度重疊探針的平臺(tái)，盡管覆蓋了較少的基因組區(qū)域，但在靈敏檢測(cè)小的變異時(shí)所需的測(cè)序量也少。

長(zhǎng)鏈非編碼RNA測(cè)序（long non-coding RNA sequencing，lncRNA-Seq）是一種使用特定方法降低樣本中rRNA 的豐度，對(duì)富集到的 RNA進(jìn)行文庫(kù)構(gòu)建，再對(duì)高通量測(cè)序儀產(chǎn)出的數(shù)據(jù)進(jìn)行信息分析的研究方法。lncRNA-Seq可一次性獲得樣本中全部的lncRNAs信息，對(duì)lncRNAs的類別、功能進(jìn)行的深入分析，從而快速準(zhǔn)確地獲得與特定生物學(xué)過程（例如發(fā)育、疾病等）相關(guān) lncRNA信息。據(jù)估計(jì),在人類基因組中,大約每千個(gè)堿基中有一個(gè)SNP,無論是比較于度多態(tài)性(RFLP)分析還是微標(biāo)記(STR),都要廣泛得多。

線粒體測(cè)序

線粒體是真核生物的重要細(xì)胞器，是生物體的能量工廠，參與能量代謝、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞凋亡等許多生命活動(dòng)，對(duì)生物的生理活動(dòng)起著至關(guān)重要的作用。大部分線粒體基因由于其母系遺傳特性以及進(jìn)化速率較快等特點(diǎn)，被廣泛地用于種群遺傳學(xué)、進(jìn)化生物學(xué)、譜系地理學(xué)和系統(tǒng)發(fā)育學(xué)、疾病診斷等學(xué)科領(lǐng)域。線粒體全基因組在生物進(jìn)化的研究中具有的優(yōu)勢(shì)。由于線粒體有著與真核生物長(zhǎng)期共生的進(jìn)化歷史，因此其基因組包含了反映物種進(jìn)化的關(guān)鍵信息，同時(shí)，相對(duì)于核基因組，線粒體基因組小，容易對(duì)大量物種進(jìn)行橫向的比較分析，有利于生物進(jìn)化的研究，因而受到進(jìn)化生物學(xué)家的鐘愛。線粒體的組成可以從兩個(gè)層面上反映物種及群體的遺傳和進(jìn)化，即核酸序列組成和基因組的結(jié)構(gòu)特征，兩者的特征具有不同的進(jìn)化機(jī)制和進(jìn)化速度，在進(jìn)化生物學(xué)研究中可以很好的互補(bǔ)。(3)在PCR儀上進(jìn)行熱變性(95C2min),冰中驟冷，待_上機(jī)。

單細(xì)胞測(cè)序（英語：Single cell sequencing）采取優(yōu)化的下一代DNA測(cè)序技術(shù)（NGS）檢測(cè)單細(xì)胞的序列，可以獲得特定微環(huán)境下的細(xì)胞序列差異以方便研究其功能差異等。對(duì)個(gè)體細(xì)胞的DNA測(cè)序可以幫助我們了解例如在中的小范圍細(xì)胞的變異；,溫度升高會(huì)使蛋白質(zhì)變性失活,因此，基于這一點(diǎn)考慮提取蛋白質(zhì)和酶時(shí)一般采用低溫(5度以下)操作。對(duì)其進(jìn)行RNA測(cè)序可以幫助我們了解和鑒別不同的細(xì)胞類型與其表現(xiàn)的基因，對(duì)研究發(fā)育生物學(xué)等有較大裨益。

分離單細(xì)胞

在全基因組擴(kuò)增和測(cè)序前，有很多方法可以分離細(xì)胞個(gè)體，其中流式細(xì)胞術(shù)（FACS）較為常用。個(gè)體細(xì)胞可以用顯微操作來收集，這樣較為快捷而且成本較低，但是比較有技術(shù)難度，而且顯微鏡下對(duì)細(xì)胞的錯(cuò)誤分類容易影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果。激光捕獲顯微切割技術(shù)（LCM）亦可以用來收集單細(xì)胞。但是盡管激光捕獲顯微切割可以保留樣本細(xì)胞在組織中的空間位置，但是捕獲單細(xì)胞的時(shí)候容易連帶周圍細(xì)胞的物質(zhì)。高通量的細(xì)胞個(gè)體分離還可以使用微流控技術(shù)。微流控技術(shù)和流式細(xì)胞技術(shù)都能準(zhǔn)確而自動(dòng)地分離無偏樣本。但是，兩種方法都要求首先將細(xì)胞從其為環(huán)境中脫離，因此可能在RNA表達(dá)分析中造成對(duì)轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)的干擾。以目標(biāo)蛋白質(zhì)3個(gè)重復(fù)具有相同趨勢(shì)，目標(biāo)蛋白質(zhì)相鄰位點(diǎn)的相對(duì)一致性，至少2個(gè)重復(fù)有2倍以上差異作為判定差異表達(dá)蛋白質(zhì)的標(biāo)準(zhǔn)。