特種集裝箱主要分為以下幾種：

開頂集裝箱(Open Top Container)

這種集裝箱的特點是箱頂可以方便地取下和裝上。箱頂又有硬頂和軟頂兩種。這種集裝箱適用于裝載大型貨物和重貨，如鋼鐵、木材，機械，特別是像玻璃板等易碎的重貨。利用吊機從頂部將貨物吊入箱內不易損壞貨物，而且也便于在箱內固定。

通風集裝箱(Venti-lated Container)

通風集裝箱的特點是在其側壁或頂壁上設有若干供通風用的窗口，適用于裝運有一定通風和防潮濕要求的雜貨，如水果、蔬菜等。如果將通風窗口關閉，又可作為雜貨箱用。

臺架式集裝箱 (Platform based Container)

這種集裝箱的特點是沒有箱頂和側壁，甚至連端壁也去掉而只有底板和四個角柱的集裝箱。

平臺式集裝箱(Plat-form Container)

這種集裝箱比臺架式集裝箱更簡化而只保留了底板。主要用于裝卸長、重大件貨物。如重型機械設備、鋼材等。

冷藏集裝箱(Reefer Container)

冷藏集裝箱也稱冷藏柜，是以運輸冷凍食品為主，能保持所定低溫的保溫集裝箱。

罐式集裝箱(Tank Container)

顧名思義這種集裝箱是專為裝運液體貨物，如酒類，化學品而設計的。

汽車集裝箱(Car Con-tainer)

這種集裝箱是專門裝運小型汽車用的。

動物集裝箱(Pen Container or Live Stock Container)

這是一種專門用來裝運雞、鴨、豬、牛等活牲畜的集裝箱。

服裝集裝箱(Garment Container)

也稱掛衣箱。這種集裝箱的特點是:在箱內上側梁上裝有許多根橫桿，每根橫桿上垂下若干條皮帶扣、尼龍帶扣或繩索，將成衣衣架上的鉤直接掛在帶扣或繩索上。

散貨集裝箱(Solid Bulk Container)

這種集裝箱是用來裝運粉狀或粒狀貨物。

20英尺加重集裝箱（Heavy Container）

這種集裝箱是來裝載體積不大但重量很重的貨物。

由于集裝箱活動房的建材和一直以來的傳統住宅有著很大的不同。這種集裝箱適于裝載玻璃板、鋼鐵制品、膠合板、機械設備等超高貨物，利用側壁可以固定的重貨，以及難以從箱門進行裝卸而必須由箱頂進行裝卸作業的貨物。相關的也指出目前中國雖不可能在短期內實施集裝箱活動房的政策，但是，至少可以采取集裝箱活動房在部分城市或者個別城市"試點"的方式進行，適當放開，等待時機和條件成熟之后，再放到全國進行實施和分布及廣泛推廣。 集裝箱活動房成本小，滿足了部分市場需求，還可以減少人們因高房價而對社會的憤怒情緒;解決因高房價或經濟收入低而購買不起房的人，以及部分流動人口在城市邊緣生活的居住問題。后，在一定程度上，可以對房價上漲過快的現象，具有一定抑制作用。

隨著我國工業化社會進程和市場經濟改革的不斷加快，“城市化”進程也在加快。越來越多的人發現：住房是他們人生中遇到的一個很大的問題，“衣食住行”之“住”既是人們生存的根本條件，又是人們的一個大的生活目標，是幸福生活的保證。集裝箱底座采用加強結構設計制造（與普通標準集裝箱不同），以提高集裝箱機械強度，承受更高的發電機組動載沖擊等。然而城市高昂的房價令城市低收入群體“望房興嘆”，他們多么希望有自己的住處。而集裝箱住房的出現讓我們重新有希望去面對城市中高額的房價。集裝箱建筑不像傳統建筑形式。它不需要建筑模板，也無需腳手架，更不會造成大量的建筑垃圾，便可以像生產汽車一樣去生產住房。有效的節省大量勞動力，更節省時間和金錢，也滿足建筑節能要求，又解決城市中高房價的問題。在深圳集裝箱住房每平方米900元左右，大多數低收入群體還是能夠支付得起。因此集裝箱住房是解決城市低收入群體住房問題的有效途徑。深圳有外來務工人員租住集裝箱住房，每個集裝箱住房每天6元，而購買集裝箱住房（約13平方米）是每個1．2萬元左右。集裝箱建筑正在引發一場住宅效率的革命。如2008年8月29日，在汶川事故三個多月后中集集團投資1000多萬元援建的“集裝箱學校”——汶川縣雁門中心學校集裝化組合校區在汶川落成。這一全國集裝化組合校區，有效的妥善解決約1000余名學生學習和生活需要。