關閉整個系統和系統各部分，在制氮機吸附罐壓力達到 0.6MPa 左右時，觀察制氮系統是否正常工作。緩慢打開放空入口截止閥，調節流量至額定流量的 1/2（醫院中心供氧系統）。調整氮氣入口閥的開度來調節氮氣的純度和流量。由人員施工，避免發生泄漏現象。成品氮氣出口至用氣點之間的管路使用銅管或不銹鋼管為（次采用新的鍍鋅管），采用焊接方式連接。電源和冷卻水引至設備現場，備好配電盤、冷卻水供應設施。 因而，藥用高純度制氮機設備在配套時，空壓機進口前端就配有油水別離器和前端的精細過濾(其一則，二則別離油)。這樣將壓縮空氣進行除油與冷凍干燥除水處理，將有效地提高了分子篩吸附才能和安穩性。

因為大氣污染的存在，空氣中的油蒸汽簡單被碳分子篩所吸附，并難以脫附，填塞微孔而使分子篩失效。別的，水對碳分子篩而言盡管不是喪命的,但會使碳分子篩負荷添加，即影響其吸附O2、CO2等氣體的才能。若結構描繪不妥就會因高速氣流的沖擊發作分子篩的跳動和彼此磨擦而粉化失效。應在吸附塔底部設置氣流分部器，在頂部設置壓緊設備，有效地防止這種表象的發作。各設備一般沿廠房墻面布置。空壓機、冷干機應放在上風口或通風良好的地方，如果空壓機后沒有空氣儲罐，則空壓機與冷干機之間的距離應盡可能大一些，二者之間的管路長度盡可能長一些，以利通過大氣環境降低壓縮空氣溫度。

觀察測氧儀指示的氧含量是否符合要求。當氮氣純度達到要求后，再緩慢打開純氣出口截止閥，將流量調至所需的流量，關閉放空入口截止閥，當設備正常運轉后即可投入使用。因為大氣污染的存在，空氣中的油蒸汽簡單被碳分子篩所吸附，并難以脫附，填塞微孔而使分子篩失效。別的，水對碳分子篩而言盡管不是喪命的,但會使碳分子篩負荷添加，即影響其吸附O2、CO2等氣體的才能。制氮機系統設備一般沒有場地基礎要求，只要廠房內平整地坪就能滿足安裝條件。但對于較大規格的空壓機、壓縮空氣干燥設備等，則按生產廠家要求實施。