盡管指紋識別技術已經進入了民用領域，但是其工作原理其實還是比較復雜的。與人工處理不同，生物識別技術公司不直接存儲指紋的圖像。該方式適應能力強，對使用環境無特殊要求，同時，硅晶元以及相關的傳感原件對空間的占用在手機設計的可接受范圍內，因而使得該技術在手機端得到了比較好的推廣。在登記過程中，用戶需要先采集指紋，然后計算機系統將自動進行特征提取，提取后的特征將作為模板保存在數據庫或其他的地方。

在登記過程中，用戶需要先采集指紋，然后計算機系統將自動進行特征提取，提取后的特征將作為模板保存在數據庫或其他的地方。光學式指紋識別主要包括4個方面功能：指紋模塊負責采集指紋圖像。數字信號處理器主要把采集到的指紋圖像轉化為數字信號。有人曾提出用汗腺孔來進行指紋識別，但這種方法要求指紋采集設備要具有非常高的分辨率。所以在實際的系統中沒有采用。

主要是利用光的折攝和反射原理，將手指放在光學鏡片上，手指在內置光源照射下，光從底部射向三棱鏡，并經棱鏡射出，射出的光線在手指表面指紋凹凸不平的線紋上折射的角度及反射回去的光線明暗就會不一樣。電容式與光學式指紋識別主要在指紋的采集方式上擁有較大差異，而在指紋的驗證過程中則基本類似。在識別或驗證階段，用戶首先要采集指紋，然后經系統自動進行指紋庫模板比對，然后給出比對結果。