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公司基本資料信息
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聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)
操作步驟
1.在冰浴中,按以下次序?qū)⒏鞒煞旨尤胍粺o(wú)菌0.5ml離心管中。
1QPCR buffer
5 μl
dNTP mix( 2mM )
4 μl
引物1(10pM)
μl 2
引物2 ( 10pM)
2μl
Taq酶(2U/ul)
1 μl
DNA模板( 50ng-1μg/μl )
1 μl
加ddH2O至
μl 50
視PCR儀有無(wú)熱蓋,不加或添加石蠟油。
2.調(diào)整好反應(yīng)程序。將上述混合液稍加離心,立即置PCR儀上執(zhí)行擴(kuò)增。-般:在93°C
預(yù)變性3-5min ,進(jìn)入循環(huán)擴(kuò)增階段: 93°C 40s→58°C 30s→72°C 60s ,循環(huán)30-35
次,后在72°C保溫7min。
3.結(jié)束反應(yīng), PCR產(chǎn)物放置于4°C待電泳檢測(cè)或-20°C長(zhǎng)期保存。
4. PCR的電泳檢測(cè):如在反應(yīng)管中加有石蠟油,需用100ul進(jìn)行抽提反應(yīng)混合液,以
除去石蠟油;否則,直接取5- 10μl電泳檢測(cè)。
STR檢測(cè)
短串聯(lián)重復(fù)(Short tandem repeats, STR),又稱微wei星DNA(Microsatellite DNA)或簡(jiǎn)單重復(fù)序列(Simple repeat sequence, SRS或SSR),是廣泛存在于原核生物和真核生物基因組中的核苷酸重復(fù)序列。用新一代高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)某物種的特定組織或細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,與參考基因組比較,可以得到基因表達(dá)差異、可變剪接、融合基因等遺傳調(diào)控信息。有絲分裂過程中DNA鏈之間的錯(cuò)配引起的fu制滑動(dòng)被認(rèn)為是導(dǎo)致STR產(chǎn)生的較為常見原因,并且依據(jù)不同fu制單元大小的不同以及不同物種之間,fu制滑動(dòng)發(fā)生的概率也不相同。
STR是以序列 (core repeat units) 首尾相連多次重復(fù)形成。98C變性2min后進(jìn)行PCR循環(huán),PCR循環(huán)參數(shù)為96C10s,50C5s,60°C4min,25個(gè)循環(huán),擴(kuò)增結(jié)束后設(shè)置4C保溫。每個(gè)STR的序列結(jié)構(gòu)相同,長(zhǎng)度為2-6bp,但其重復(fù)單位數(shù)目和重復(fù)區(qū)域的長(zhǎng)度不同,因此STR在不同種族、不同人群之間的分布具有差異性,構(gòu)成了STR遺傳多態(tài)性。不同個(gè)體之間在一個(gè)同源STR位點(diǎn)的重復(fù)次數(shù)也不同,因而同指紋識(shí)別一樣,STR位點(diǎn)分析也可對(duì)個(gè)體進(jìn)行身份識(shí)別。通過識(shí)別個(gè)體基因組在特定位點(diǎn)的特定序列重復(fù),即可創(chuàng)建其基因檔案?;诖?,STR分析法已經(jīng)成為一種重要的鑒定分析方法,應(yīng)用于法醫(yī)學(xué)、qin子鑒定及細(xì)胞鑒定等領(lǐng)域。