早在八十年代， Bains W. 等人就將短的 DNA 片斷固定到支持物上，借助雜交方式進行序列測定。但基因芯片從實驗室走向工業(yè)化卻是直接得益于探針固相原位合成技術和照相平板印刷技術的有機結合以及激光共聚焦顯微技術的引入。它使得合成、固定高密度的數(shù)以萬計的探針分子切實可行，而且借助基因芯片激光共聚焦顯微掃描技術使得可以對雜交信號進行實時、靈敏、準確的檢測和分析。產(chǎn)品即將或已有部分投放市場，產(chǎn)生的社會效益和經(jīng)濟效益令人瞻目。

盡管如此，通常原位合成方法仍然比較復雜，除了在基因芯片研究方面享有盛譽的 Affymetrix 等公司使用該技術合成探針外，其它中小型公司大多使用合成點樣法。后一方法在多聚物的設計方面與前者相似，合成工作用傳統(tǒng)的 DNA 或多肽固相合成儀以完成，只是合成后用特殊的自動化微量點樣裝置將其以比較高的密度涂布于纖維膜、尼龍膜或玻片上。支持物應事先進行特定處理，例如包被以帶正電荷的多聚賴酸或氨基硅烷。現(xiàn)在已有比較成型的點樣裝置出售，如美國 Biodot 公司的點膜產(chǎn)品以及 Cartesian Technologies 公司的 PixSys NQ/PA 系列產(chǎn)品。前者產(chǎn)生的點陣密度可以達到 400/cm2 ，后者則可達到 2500/cm2 。

基因芯片是一種中小型剖析設備，能夠迅速和準確地科學研究生物基因信息。制做基因芯片時，可以用機械手臂把很多已經(jīng)知道或不明編碼序列的DNA片段點在玻璃鏡片(一般為2cmX2cm)、銅片或尼龍膜上，再經(jīng)物理吸附功效做到固定化(cDNA芯片)。可以直接在金屬板或金屬表層開展有機合成，從而獲得寡聚核糖核苷酸芯片。