微通道反應器特別的結構賦予其一系列的性能，故被應用于許多領域。例如，氨基甲酸酯的多步化學合成可以通過連續性工藝來實現，其中包括分步反應工序和反應步驟間的兩步分離工序。通過使用一系列串聯的由三個微通道反應器和兩個相分離器組成的反應裝置，可以在一個緊湊型芯片基的工藝系統中實現溶劑轉換、危險中間產物原位生產和消耗、高能量化學品的安全處理以及化學品的小批量生產。因此，可以用于快速及放熱反應、工業環境拓展等方面。

微通道反應器行業有廣闊的應用前景

用傳統的釜式反應器，反應放出的熱量不能及時的釋放，反應溫度不能控制，利用微通道反應器能克服釜式反應器的缺點，如果關于微反應器的這個預言是正確的，那么這將是對化工工藝的一次完全的改革，這種新化工工藝必然會有廣闊的應用前景。

微通道反應器采用連續流動的方式進行反應，對于反應速度很快的化學反應，可以通過調節反應物流速和微通道的長度，控制它們在反應器中的反應時間。

近年來，微反應器技術已經開始在實驗室和工業規模上影響化學加工的概念，這一點越來越明顯。在過去的幾年里，實驗室研究人員已經收集到證據，證明微反應器技術可以成功地應用于幾乎所有的有機化學領域。這項新技術的一大優點被認為是更高的產率和選擇性，更有效地利用資源(對環境友好)和更強大的反應控制(避免boom，使等溫線反應控制成為可能)。這就打開了通向優雅的組合反應器布置的通道，包括在線分析設備或涂有多相催化劑的微通道，同時大限度地利用了微反應器增強的表面體積比。