盡管指紋識別技術已經進入了民用領域，但是其工作原理其實還是比較復雜的。與人工處理不同，生物識別技術公司不直接存儲指紋的圖像。該方式適應能力強，對使用環境無特殊要求，同時，硅晶元以及相關的傳感原件對空間的占用在手機設計的可接受范圍內，因而使得該技術在手機端得到了比較好的推廣。電容式與光學式指紋識別主要在指紋的采集方式上擁有較大差異，而在指紋的驗證過程中則基本類似。

主要是利用光的折攝和反射原理，將手指放在光學鏡片上，手指在內置光源照射下，光從底部射向三棱鏡，并經棱鏡射出，射出的光線在手指表面指紋凹凸不平的線紋上折射的角度及反射回去的光線明暗就會不一樣。我們手掌及其手指、腳、腳趾內側表面的皮膚凸凹不平產生的紋路會形成各種各樣的圖案。這些紋路的存在增加了皮膚表面的摩擦力，使得我們能夠用手來抓起重物。目前的電容式指紋模塊也分為劃擦式與按壓式兩種，前者雖然占用體積較小，但在識別率以及便捷性方面有很大的劣勢。

電容式指紋識別要比光學式的復雜許多，其原理是將壓力感測、電容感測、熱感測等感測器整合于一塊芯片中，當指紋按壓芯片表面時，內部電容感測器會根據指紋波峰與波谷而產生的電荷差（或是溫差），形成指紋影像，再通過與手機內部的指紋庫進行匹配，從而完成指紋識別。因為這些應用中所使用的采集器往往面積較小，較難完整地采集到中心點和三角點。交叉和小島由于計算上的困難，在實際的系統中往往不予采用。指紋識別技術很重要的一個指標就是準確率，而提高指紋識別準確率的在于能否、的采集指紋圖像。